- a -

• ambientOcclusionNumDirectionsChanged() : Window

- c -

• calculateAmbientOcclusionMap() : Canvas
• calculateDirections() : Direction
• Camera() : Camera
• Canvas() : Canvas
• centerMolecule() : Molecule
• colorModeChanged() : Window

- d -

• Direction() : Direction
• draw() : Molecule
• drawEdges() : Canvas
• drawHalos() : Canvas
• drawPostProcess() : Canvas
• drawScene() : Canvas

- f -

• findCameraTranslation() : Molecule
• findChainColor() : Molecule
• findColor() : Molecule
• findMoleculeCenter() : Molecule
• findRadius() : Molecule

- g -

• get() : Direction
• getBoundingSphereRadius() : Molecule
• getPosition() : Camera
• getProjectionMatrix() : Camera
• getViewMatrix() : Camera , Direction

- i -

• initGL() : Molecule
• initializeGL() : Canvas

- l -

• loadData() : PDBLoader
• loadModel() : Canvas

- m -

• Molecule() : Molecule
• mouseMoveEvent() : Canvas
• mousePressEvent() : Canvas
• mouseReleaseEvent() : Canvas

- o -

• onBackgroundColorClick() : Window
• onEdgeColorClick() : Window
• onHaloColorClick() : Window
• onLoadFileClick() : Window

- p -

• paintGL() : Canvas
• PDBLoader() : PDBLoader

- r -

• radiusTypeChanged() : Window
• resizeGL() : Canvas
• rotateX() : SceneObject
• rotateX_World() : SceneObject
• rotateY() : SceneObject
• rotateY_World() : SceneObject
• rotateZ() : SceneObject
• rotateZ_World() : SceneObject

- s -

• SceneObject() : SceneObject
• setAmbientIntensity() : Window
• setBackgroundColorButton() : Window
• setDepthAwareness() : Window
• setDiffuseIntensity() : Window
• setEdgeColorButton() : Window
• setEdgeThickness() : Window
• setHaloColorButton() : Window
• setHaloDepthThreshold() : Window
• setHaloSize() : Window
• setPosition() : SceneObject
• setProjectionMatrix() : Camera
• setSpecularExponent() : Window
• setSpecularIntensity() : Window

- t -

• toggleAmbientOcclusion() : Window
• toggleSpecular() : Window
• translate() : SceneObject

- w -

• wheelEvent() : Canvas
• Window() : Window

- ~ -

• ~Camera() : Camera
• ~Canvas() : Canvas
• ~Molecule() : Molecule
• ~PDBLoader() : PDBLoader
• ~SceneObject() : SceneObject
• ~Window() : Window