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Laden eines Datensatzes
Um einen Datensatz zu laden gibt es zwei Möglichkeiten: Im Menü File den Unterpunkt Open oder in der Symbolleiste das erste Symbol (
). Wird eine dieser Möglichkeiten ausgeführt erscheint ein Dialog in dem die XML-Datei (*.xml) gewählt werden kann.
Es können sowohl Rohdaten als auch vorher abgespeicherte Datensätze geöffnet werden.
Anzeigebereich
In diesem Bereich wird der gesammte Graph angezeigt. Durch Drücken der linken Maustaste und ziehen kann der Graph am Bildschirm verschoben werden (Pan). Die Größe kann mit dem Mausrad verändert werden, wobei immer die Mausposition fixiert wird.
Um mit dem Graphen zu interagieren gibt es mehrere Möglichkeiten: Einerseits ist es möglich durch Drag&Drop Knoten zu verschieben. Wird einer dieser Knoten über einem anderen Knoten fallen gelassen werden die beiden Knoten zu einem Gruppenknoten (Adjazenzmatrix) zusammengefügt. Die andere Variante um Knoten zu gruppieren ist es, durch halten der STRG-Taste und ziehen eine Menge an Knoten zu selektieren. Wenn der Graph zu unübersichtlich wird, kann er automatisch relayoutet werden. Dies ist über "File" -> "Relayout" möglich.
Gruppen können mit einem Rechtsklick auf diese wieder aufgelöst werden. Ebenso ist es möglich, einzelne Zeilen oder Spalten aus einer Matrix herauszuziehen. Soll die Reihenfolge in einer Matrix geändert werden, wird dies dadurch erreicht, dass man eine Zeile oder Spalten auf eine andere zieht.
Welche Informationen angezeigt werden sollen kann über die Buttons "Labels" und "Titles" konfiguriert werden. Die Titel der einzelnen Gruppen können durch einen Doppelklick auf diesen verändert werden.
Speichern
Aktuelle Graphen können durch Klicken auf den Speichern Button (
) oder im Menü "File" auf "Save" in einem XML-Format gespeichert werden.
Des weiteren ist es Möglich Bilder über "File" -> "Save Image" oder über den Button 
abgespeichert werden.